水务局党组辖县级单位3个：市节水型社会建设办公室、甘兰水利水电建筑设计院和市水利水电工程局。
    局所属科级单位28个，其中行政科室6个（办公室、政工科、财务科、水政科、离退休职工管理科、规划计划科），机关事业科室11个（水资源办公室、水土保持站、后勤服务队、工会、工程建设科、质量监督站、水利管理科、水利科学研究所、抗旱防汛科、综合经营科、水量调度办公室），基层站所9个（黑河干流管理总站，该站下设6个分站；酥油口水库管理所；灌溉试验站），事业单位企业化管理的单位2个（抗旱服务队、物资供应站）。
    现有职工475人，其中：市水务局219人，节水办18人，设计院91人，工程局147人。
    市水务局219人中，其中干部75人，工人144人。科级干部54名。专业技术人员65人（高级职称10人，中级职称27人，初级职称28人）。全局离退休职工129人
    局党总支下设10个党支部，党员149人（含离退休51人）。
    现有县级干部17名，其中：市水务局10名，市节水办3名，工程局2名，甘兰设计院2名。